Si notion d’Eucaryotes a une réalité phylogénétique, celle de « Procaryotes » est moins évidente. Il s’agit en réalité de cellules sans noyau et du qualificatif correspondant : cellules procaryotiques. On peut y voir par une certaine ressemblance structurelle des Bactéries au sens large. En effet l’ADN se trouve directement dans le cytoplasme des cellules qui autour des membranes présentent une ou plusieurs parois.
Les « Procaryotes » forment deux lignées bien différenciées : les Archées et les Eubactéries.
